GMP實驗室是一個清潔的實驗室，一個完整的GMP實驗室，大致分為以下功能區。
　　（1） 準備室
　　制備室用于制備培養基和樣品處理。房間內有試劑柜、存放儀器或材料的專用柜、實驗臺、電爐、冰箱、污水管、電源等。
　　GMP實驗室
　　（2） 洗滌室
　　洗滌室用于洗滌餐具等。由于使用過的餐具被微生物污染，也可能存在致病微生物。因此，在條件允許的情況下，最好設置一個洗衣房。室內應該有用于洗滌用具的加熱器、蒸鍋、盆、桶等，以及各種瓶刷、洗滌劑、肥皂、洗衣粉等。
　　（3） 滅菌室
　　滅菌室主要用于培養基和各種儀器的滅菌。房間應配備高壓蒸汽消毒器、烤箱和其他消毒設備和設施。 　　（4） 無菌室
　　無菌室，也稱為接種室，是用于系統接種、菌株純化和其他無菌操作的專業實驗室。在微生物工作中，菌種的接種和移植是一項主要操作，這種操作的特點是確保菌種的純度，防止雜菌污染。在一般環境的空氣中，由于存在許多灰塵和雜菌，容易造成污染，極大地干擾疫苗接種工作。
　　gmp實驗室應配備儀器和設備：
　　包括：流式細胞儀、PCR儀、超速/高速/低速離心機、液氮裝置、自動血細胞分離器、生物安全柜、CO2培養箱等。